Akvaryumlardaki su sıcaklığı hayvanlar ve bitkiler için belirleyici bir öneme sahiptir ve bu nedenle mutlaka gözlemlenmelidir. Tropikal süs balıklarının çoğu 24 ila 26°C arasındaki sıcaklıklarda kendilerini en rahat hisseder. Ancak daha düşük sıcaklıkları tercih eden balıklar da vardır. Diskus çiklitler 27 ila 29 °C arasındaki daha yüksek sıcaklıkları ideal olarak algılayan balıklar grubuna aittir. Aksolotllar ve çoğu tatlı su karidesleri daha serin sıcaklıkları tercih ederler.
Su sıcaklığı ayarlı ısıtıcılarla (JBL PROTEMP s veya JBL PROTEMP e) veya soğutucularla (JBL Cooler) yükseltilip düşürülebilir.